شهید دکتر محمد چوبکار بعد از تعطیلی دانشگاه به عضویت سپاه پاسداران کرمانشاه درآمد و علاوه بر حضور در جبهه های نبرد حق علیه باطل مدتی مسئول واحد بسیج کرمانشاه بود. در همان دوران ازدواج کردند که حاصل ان دو دختر می باشد. با بازگشایی دانشگاهها در اردیبهشت ماه سال 61 مجددا به دانشگاه بازگشت و مشغول تحصیل شد با توجه به لیاقت و شایستگی ایشان از طرف کلیه دانشجویان پزشکی ورودی 58-1357 به عنوان نماینده دانشجویان برگزیده شدند که مدتی اقدامات مفیدی در این خصوص انجام دادند. با وجودی که در حین تحصیل به کرات به علت نیاز جبهه در عملیاتهای مختلف شرکت می کردند ولی هرگز از کسب علم غفلت نمی نمودند و در سرتاسر دوران تحصیل جزو دانشجویان ممتاز دانشکده بود. شهید علاقه خاصی به قرائت قرآن داشت و قرآن را با صوت خوش تلاوت می کرد نسبت به خانواده متعهدانه و با احترام برخورد می کرد و تلاش زیادی در رشد و تربیت اسلامی فرزندانش می نمود بطوری که دو فرزندش که از سنین 4 و 5 سالگی به راحتی قادر به خواندن کلمات متن روزنامه بودند.