شهید قرنی تابع ولی‌فقیه بود گسترش فعالیت او در حکومت پهلوی ناگفته‌های پنهان شاه را برای او روشن کرد و همین اطلاعات باعث مخالفت او با رژیم پهلوی و مبارزه با آنها گردید. اقدامات وی باعث دستگیری، حبس و در آخر اخراج او از ارتش شد. شهید محمد‌ولی قرنی پس از قیام پانزدهم خردادماه 1342  به‌واسطه آشنایی‌اش با «آیت‌الله میلانی» و «آیت‌الله مصطفی خمینی» فعالیتش را بر علیه مبارزه با شاه بیشتر کرد و این اقدامات تا پیروزی انقلاب اسلامی ادامه یافت. پس از پیروزی انقلاب اسلامی او به‌عنوان اولین رئیس ستاد ارتش جمهوری اسلامی ایران انتخاب شد و توانست جلوی پیشروی ضد انقلاب در کردستان را بگیرد. سرانجام زندگی او ختم به شهادت شد... حجت‌الاسلام سیدمحمدعلی آل هاشم امام جمعه تبریز و نماینده رهبر معظم انقلاب در آذربایجان شرقی درباره سپهبد شهید قرنی می‌گوید: شهید قرنی در تبعیت از امام خمینی (ره) یک اسوه ماندگار بود. وی نظامیِ معتقدی بود که میزان دلسوزی‌اش نسبت به انقلاب و نظام به حدی بود که در سن 66 سالگی هم تمام تلاش خود را در به ثمر رساندن انقلاب و حفظ آن انجام می‌داد.