شهید مدافع حرم سید مجتبی حسینی به سال ۱۳۶۲ و در شهر مقدس قم به دنیا آمد، پدرش فردی مذهبی و مقید بود و همین امر زمینه تربیت دینی سید مجتبی و آشنایی او با سیره اهل بیت و مکتب زینب سلام الله علیه را فراهم می نمود.
سید مجتبی حسینی دوران کودکی و نوجوانی خود را در محله بلوار سمیه قم سپری کرد و در دانشگاه در رشته کامپیوتر مدرک کارشناسی را گرفت. مهندس سید مجتبی حسینی پس از فارغ التحصیلی به حوزه رفت و مشغول فراگیری علوم دینی در یکی از حوزه های علمیه شهر قم شد و در برگزاری هیات و مراسم های مذهبی بسیار فعال و کوشا بود.