از ویژگی های بارز اخلاقی و اعتقادی وي زهد و تقوا و عبادت شبانه، عشق به ولایـت اهل بیت علیه السلام مردم داری، تواضع و ایثـار، بردباری، شجاعت و دلاوری و بزرگـواری روح را می توان نام برد. هرگز دست کسی را که به سویش دراز می شد ناامید نمی ساخت و می گفت: «مطمئن باشید اگر نیاز نداشت دستش را دراز نمی کرد». وی سرانجام در 4 شهریور 1375ش به علت مصدومیت شیمیایی، به فیض شهادت نایل گردید و پیکر پاکش، در قطعه محرم، به خاک سپرده شد. شیخ احمد سالک، نخستين فرمانده سپاه اصفهان، در مورد وی چنین می گوید: «شهید حاج علی اکبر آقابابایی اسوه صداقت و وفای به عهد بود. او در محراب، مرد ذکر و در رسيدگي به محرومان و مستضعفان، مرد عمل و در مقابله با كفر و شرك و نفاق، مرد ميدان و مبارزه بود».