تولد تا جواني حجت الاسلام والمسلمين حاج شيخ غلامحسين حقاني،‌ چهارم فروردين سال 1320(هـ.ش) در خانواده اي مذهبي در شهر خون و قيام قم متولد شد. پدرش حجت الاسلام والمسلمين شيخ محمد حقاني از روحانيان زاهد و خوشنام حوزه بود. شهيد غلامحسين حقاني در سنين كودكي به همراه خانواده به تهران هجرت و در جنوب شهر و در حوالي دروازه غار، سكونت كردند. پس از ورود به تهران تحصيلات ابتدايي را آغاز كرد و پس از گرفتن مدرك ششم ابتدايي به جهت علاقه وافر خود و با تشويق پدرش به فراگيري علوم ديني روي آورد.   مرحوم پدر شهيد غلامحسين حقاني درباره دوران كودكي او چنين نقل مي كند: «او در دوران كودكي اخلاق حميده اي داشت و تا آنجا كه به ياد دارم در سني كه روزه گرفتن بر او واجب نبود، در ماه مبارك رمضان روزه دار بود. به عبادت و بندگي خداوند از همان كودكي دل داده بود و نمازش حتي الامكان قضا نمي شد.»   شهيد حقاني ابتدا مقدمات و ادبيات را در مدرسه حضرت آيت الله حاج شيخ احمد مجتهدي تهراني(ره) واقع در خيابان 15 خرداد(بوذر جمهري نو) و تحت نظر ايشان فرا گرفت و همزمان در حوزه علميه مروي تهران از محضر پدر بزرگوارش نيز بهره مند شد. مبارز شهيد ، پس از كسب علوم مقدماتي حوزه در سال 1335(هـ .ش) با موافقت پدرش به زادگاه خود يعني شهر مقدس قم بازگشت تا مرحله جديدي از تحصيل فقه پوياي شيعه را آغاز كند. او در زمان تحصيل در حوزه پر خير و بركت قم در محضر حضرت امام خميني (قدس سره الشريف)، آيت الله العظمي سيدمحمدرضا گلپايگاني، آيت الله محقق داماد، آيت الله عباسعلي شاهرودي،‌ آيت الله شيخ مرتضي حائري يزدي، آيت الله سيد محمدباقر سلطاني تلمذ كرد و با بهره مندي از بحر جوشان علوم و معارف اسلامي به درجه اجتهاد نائل آمد. همزمان با تحصيل در حوزه علميه قم،‌ تحصيل در مقطع متوسطه را در مدرسه دين و دانش قم تحت مديريت شهيد مظلوم آيت الله دكتر سيد محمدحسيني بهشتي به پايان رساند. شهيد حقاني در همين ايام بود كه با تهذيب نفس خود را براي جهاد اكبر و مبارزه با طاغوت آماده كرد.