«مهاجر الی الله» مشتمل بر ۹ فصل می‌باشد که هشت فصل ابتدایی آن خاطرات آیت‌الله مویدی از اوضاع سیاسی، اجتماعی و فرهنگی کشور از سال ۱۳۲۰ تا سال ۱۳۵۷ و دوران پیروزی انقلاب اسلامی است و فصل انتهایی به دوران بعد از پیروزی انقلاب و مسئولیت‌های ایشان در آن دوره می‌پردازد. در برشی از مقدمه این اثر آمده است: «خاطرات آیت‌الله مویدی فارغ از ابعاد آموزنده معنوی، از این منظر که بخش اصلی حوادث آن در فضای اختناق‌آمیز پس از دستگیری امام خمینی روی داد، قابل توجه است و بازخوانی خاطرات ایشان می‌تواند زوایای جدیدی از روند مبارزه با رژیم پهلوی را بازگو کند.»