تأسیس دانشگاه اسلامی شرایط سیاسی و اجتماعی به امام اجازه داد به نشر علوم و آثار اسلامی و تربیت شاگردان بپردازد. چرا که به علل مختلفی گروه‌ها و فرقه‌های بسیاری در اسلام پدید آمده بود و نظریات گوناگونی از قبیل جبر و تفویض و غلو به وجود آمده بود. امام با استفاده از سه راه به مبارزه علمی پرداختند: اول؛ تشکیل مجالس درس عمومی که در آن همه اعم از شیعه و اهل سنت شرکت می‌کردند؛ دوم؛ مجالس خصوصی که اغلب در منزل امام (علیه‌السّلام) تشکیل می‌شد و در آن فقط خواص شرکت می‌کردند. سوم؛ تربیت شاگردانی چون هشام بن حکم، مفصل ،مؤمن طاق و ‌‌‌‌‌‌‌‌... تعداد شاگردان امام را تا چهار هزار نفر نوشته اند