سردار علیخانی پس از پایان جنگ تحمیلی با وجود اینکه ازمجروحین و جانبازان شیمیایی دفاع مقدس به شمار میرفتند ، به دلیل انگیزه بسیار بالایی که برای خدمت به کشور و دفاع از حریم انقلاب و اسلام داشتند وازآنجا که ایشان در دوران دفاع مقدس خود را از نظرشجاعت،تخصص،وعشق به وطن واسلام وشهادت به اثبات رسانده بودند،باعث شده بود که هم به خواست خود و هم به درخواست فرماندهان سپاه پاسداران تا سال1387در عضویت سپاه پاسداران انقلاب اسلامی باشند واین سالها هم همانند هشت سال دفاع مقدس با عشق به اسلام و وطن وروحیه ی شهادت طلبی درمکانهای خاص وحساس به خدمت خود ادامه دادند، که می توان به فرماندهی در پاسگاه های مرزی از جمله شلمچه و کردستان و... در آن سالهای حساس بعد از جنگ اشاره کرد. سرانجام بعد از۲۸سال خدمت شجاعانه و فداکارانه اش ،در راستای حراست و پاسداری از انقلاب و مرزهای این مرز و بوم ازنظر نظامی خدمتشان پایان یافت.